1、在核酸蛋白檢測儀使用前，首先連接好所需配套儀器：層析柱、恒流泵、自動部分收集器、記錄儀(色譜工作站)。將各類插頭與插座接妥(220V電源)。2、按下檢測儀ON電源開關，電源指示燈亮，說明整臺儀器電源開始工作，然后觀察光源指示燈，如果亮了，表示光源已開始工作，整臺儀器可進入工作狀態，將檢測儀波長旋鈕旋到所需波長刻度上，把量程旋鈕撥到100%T檔(儀器預熱20分鐘，待基線平直后可加樣測試)。
3、接通記錄儀電源開關，使電源開關撥到“通”指示燈亮。可根據記錄儀說明書調換不同的紙速度，用戶根據需要自行掌握，測量用10mV檔。此時記錄儀指針從零點開始向右移動某一刻度，調節檢測儀“光量”旋鈕使指針停留在記錄儀大約中間位置5mV左右數字顯示為50左右。。
4、把核酸蛋白檢測儀進樣口聚乙烯塑料管接到恒流泵上，使凝膠層析柱中緩沖液流過檢測儀(恒流泵流量視凝膠層析柱大小選1-3ml/min)。用“調零”調整吸光度A值為0(量程開關撥到100%T調節光量旋鈕，使記錄儀指針在10mV數字顯示為100，即透光率為100%。把量程開關撥到“0.05A”檔，緩慢調節A調零旋鈕，使記錄儀指示在“O”位，檢測儀顯示為“O”)。
5、以上步驟結束，析系統平衡后即可用洗脫液開始洗脫樣品，洗脫前再調一次吸光度0點。洗脫過程結束前不可再調節“調零”旋鈕。當洗脫液流過檢測儀時，吸光度顯示大于零的數值，吸光度數值大小隨樣品的濃度而變化。洗脫完畢后吸光度顯示為稍大于零的數值。
6、數字顯示吸光度和記錄儀自動繪制吸光度圖譜是兩個互相獨立的檢測系統，數字顯示吸光度與記錄儀所繪峰值大小沒有直接關系，不可互相換算。
7、測試完畢后，必須切斷電源，并用蒸餾水清洗樣品池和聚乙烯塑料管。
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