超聲波破碎是很激烈的破碎辦法，適用于少數(shù)微生物的破碎。
普通桿菌比球菌易破碎，G-xijun比G+xijun易破碎，對(duì)酵母菌的效果較差。
但超聲波發(fā)生的化學(xué)自在基團(tuán)能使某些敏理性活性物質(zhì)失活。
超聲波破碎的無(wú)效能量應(yīng)用率極低
由于對(duì)冷卻的要求相當(dāng)苛刻，所以不易縮小，但在實(shí)驗(yàn)室小規(guī)模細(xì)胞破碎中常用。超聲波細(xì)胞破碎儀
超聲波細(xì)胞破碎儀運(yùn)用留意事項(xiàng)：     1 、切記空載（一定要將超聲變幅桿拔出樣品后才干開(kāi)機(jī),）    2、變幅桿（超聲探頭）入水深度： 1.5Cm 左右，液面高度zui好有30mm以上，探頭要居中，不要貼壁。超聲波是垂直縱波，插入太深不容易構(gòu)成對(duì)流，影響破碎效率。    3、超聲參數(shù)設(shè)置：設(shè)置鍵好儀器任務(wù)參數(shù)（詳細(xì)設(shè)置見(jiàn)闡明書(shū)或來(lái)電征詢(xún)），關(guān)于對(duì)溫度要求比擬敏感的樣品（比方xijun）一般里面采用冰浴，實(shí)踐溫度一定是低于25度，蛋白核酸肯定不會(huì)變性。   1）  工夫：超聲時(shí)間每次zui好不要超越5秒 ，間隙時(shí)間應(yīng)大于或等于超聲時(shí)間，以便于熱量分發(fā)。時(shí)間設(shè)定應(yīng)以超聲時(shí)間短，超聲次數(shù)多準(zhǔn)繩，可延伸超聲機(jī)子以及探頭的壽命。    2）  超聲功率： 不宜太大，以免樣品飛濺或起泡沫，如小于10ml樣品容量，功率應(yīng)在200w以?xún)?nèi),選用2mm超聲探頭，另將面板前面的變幅桿選擇開(kāi)關(guān)打到相應(yīng)擋；10-200ml樣品容量的功率在200－400w，選用6mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿打到相應(yīng)擋；200ml以上的樣品容量功率在300-600w之間，選用10mm超聲探頭，另將面板后面的變幅桿打到相應(yīng)擋；（2MM的小探頭功率嚴(yán)禁超過(guò)350W）  3）  容器選擇：有多少的樣品就選多大的燒杯，這樣也是有利樣品在超聲中對(duì)流，進(jìn)步破碎效率。例如；20ML的處置量zui好用20ML的燒杯。  如100ml大腸桿菌樣品設(shè)置參數(shù)： 超聲5秒 ／間隙5秒 次數(shù)70次（總時(shí)間為10分鐘）。功率300W（僅供參考）   500ML左右的量，功率開(kāi)到500W-800W左右   4、若樣品放在1.5ml的EP管里請(qǐng)一定要將EP管固定好，以防冰浴消融后液面下降招致空載  5、日常保養(yǎng)：用完后用酒精擦洗探頭或用清水停止超聲. 
選擇破碎方法的根據(jù)：
細(xì)胞處理量；
細(xì)胞壁強(qiáng)度和構(gòu)造(高聚物交聯(lián)水平、品種和壁厚度)；
目的產(chǎn)物對(duì)破碎條件的敏感性；
破碎程度；
目標(biāo)產(chǎn)物的選擇性釋放.