熒光定量PCR(Quantitative Real-time PCR, qPCR)是一種在DNA擴增過程中實時監測熒光信號變化的生物技術。它通過在PCR反應體系中加入熒光染料或熒光標記探針,實時跟蹤PCR產物的**。熒光定量PCR的準確性可能會受到多種因素的影響,包括但不限于:
1、實驗設計
引物設計:引物必須與目標序列具有高度特異性,以避免非特異性擴增。設計不當的引物可能會導致錯誤的目標識別或形成引物二聚體,這都會降低檢測的準確性。
模板質量:模板DNA或RNA的純度和完整性對PCR效率至關重要。污染或者降解的模板可能導致擴增失敗或結果不可靠。
2、試劑與設備?
試劑盒靈敏度和特異性差異直接影響結果。?
儀器控溫精度(如邊緣效應)、CCD/PMT性能及校準狀態均會引入誤差?。
3、酶的種類與濃度
需要使用適量的Taq DNA聚合酶,濃度過高可能導致非特異性擴增,而過低則會減少產物量。
4、操作規范?:包括加樣精度、污染控制(如手套更換)及移液器清潔度,操作失誤易引發假陽性/陰性。?
5、?交叉污染?:實驗環境中殘留的DNA氣溶膠或試劑污染是假陽性的主要來源。
6、 反應條件
反應體系:包括酶、dNTPs、緩沖液、熒光染料或探針的選擇和配比。優化的反應體系有助于提高擴增效率和特異性。
PCR條件:如變性、退火和延伸的溫度及時間參數需要根據特定的實驗需求進行優化。
7、 質量控制措施
內參基因:使用內參基因進行數據標準化,可以減少由于樣品量變化帶來的變異,確保結果更加可靠。
陰陽性對照:每次實驗都應該包含陽性對照和陰性對照,用于監控整個實驗過程中的污染情況和反應條件是否正常。
8、循環次數:過多的循環次數可能引入非特異性產物,影響結果的準確性。
9、dNTP的濃度:dNTP的濃度要平衡,過高會與Mg2+結合,降低游離Mg2+的濃度,影響酶活性。
10、擴增效率:擴增效率過低(<90%)或過高(>110%)可能表明引物設計不佳、標準品稀釋錯誤或存在抑制劑等問題。
綜上所述,為了確保熒光定量PCR實驗結果的準確性和可重復性,研究人員需要綜合考慮上述各個方面,并采取相應的質量控制措施。熒光定量PCR廣泛應用于醫學研究、分子生物學研究、臨床診斷、病原體檢測、基因表達分析等領域,是現代生物科學研究和應用中不可或缺的技術。?